Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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