Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk3Q3U3Q1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms