Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gse1Q3U3C9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gse1Q3U3C9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms