Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a5Q3U1J0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a5Q3U1J0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a5Q3U1J0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a5Q3U1J0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a5Q3U1J0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a5Q3U1J0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a5Q3U1J0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a5Q3U1J0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a5Q3U1J0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a5Q3U1J0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a5Q3U1J0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms