Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms