Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms