Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TraddQ3U0V2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TraddQ3U0V2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms