Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms