Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl4Q3TZA2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl4Q3TZA2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms