Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy4Q3TYX8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms