Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms