Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc10Q3TLI0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms