Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms