Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms