Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd8Q3TA59 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd8Q3TA59 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd8Q3TA59 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd8Q3TA59 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd8Q3TA59 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd8Q3TA59 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd8Q3TA59 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd8Q3TA59 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd8Q3TA59 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd8Q3TA59 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd8Q3TA59 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd8Q3TA59 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd8Q3TA59 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd8Q3TA59 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd8Q3TA59 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms