Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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Shroom4Q1W617 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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Shroom4Q1W617 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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Shroom4Q1W617 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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Shroom4Q1W617 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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Shroom4Q1W617 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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Shroom4Q1W617 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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