Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cpne9Q1RLL3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cpne9Q1RLL3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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