Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms