Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ptchd1Q14B62 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ptchd1Q14B62 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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