Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Rpusd2Q149F1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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Rpusd2Q149F1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Rpusd2Q149F1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Rpusd2Q149F1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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