Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms