Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms