Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col19a1Q0VF58 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col19a1Q0VF58 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms