Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms