Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms