Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms