Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms