Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms