Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnn2Q08093 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn2Q08093 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms