Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MestQ07646 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MestQ07646 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MestQ07646 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MestQ07646 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MestQ07646 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MestQ07646 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MestQ07646 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MestQ07646 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MestQ07646 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MestQ07646 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MestQ07646 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MestQ07646 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms