Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms