Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms