Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nfe2Q07279 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms