Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms