Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms