Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms