Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms