Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms