Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms