Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms