Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms