Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms