Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.2 ms