Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmb4P99026 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb4P99026 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms