Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shc1P98083 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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