Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms