Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms