Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Bop1P97452 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Bop1P97452 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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