Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms