Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim43bP86448 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms